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有关《黑客帝国》的问题，行家来。
1.那个法国佬是与先知同时出现的早期的程序，他们游离于；硬件与人脑之外，是独立的存在，不依靠任何载体。本来他是要被母体删除的，但是却并没有，而且他拥有独立编程的能力，他的手下大都是他编制的
2.意思就是我是这个母体的主机，一切程序都连接在我这里，母体是我计算并编制的，但是前期作品都不完善，都崩溃了。而前五任救世主中与你区别的是，他们都没有被编入爱的程序。你是第六任救世主，前五任都完成了他们的使命：带领锡安，从锡安的毁灭中升级母体，再挑选16女7男重建锡安，等待母体的下一次升级。你的崔尼蒂闯进了母体，她快死了，从这个门出去就可以救你的崔尼蒂，从这个门出去就可以救人类
3.先知是个程序，她（暂且用她吧）从没有干预现实，只是引导人心，从头到尾先知是最大的干预者，她掌握着全局，他没有回到现实吧，你是说她回到了起始状态，而没有被史密斯感染。哦，史密斯被删除了，当然就恢复了原样了
4.先知要和平，不希望战争继续，所以他需要史密斯强大，以便让AI无法在控制母体，是母体失去平衡，迫使AI与尼奥达成协议，从而终止战争
5.尼奥死没死不确定，因为大部分借读的人都认为锡安的世界也是一个虚拟世界，因为机械乌贼竟然被尼奥组织了，尼奥还有预知能力，以及尼奥说：我感觉到了、还有史密斯侵入了人脑、崔尼蒂看着尼奥阻止机械乌贼面露不可思议的表情（似乎潜台词是：怎么会这样，锡安...）。
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黑客帝国
《黑客帝国》的故事
黑客帝国 Ⅰ ：
托马斯•安德森是一个貌似普通的年轻人，但他一直用两种方式生活着。一个身份是在一家体面的软件公司里做程序设计员，和所有普通人一样过着平淡无奇的生活；而另一个身份则是电脑世界里的著名黑客，化名是尼奥。作为一个独自居住的人，他一直在做噩梦，就在这一天晚上，他遇到了改变他生活的事件。
在尼奥遇到崔尼蒂后，他的生活就开始变得诡异起来。当他上班时，他接到一个奇怪的电话，并遇到莫名其妙的追杀。
尼奥和特工史密斯的遭遇就象是一个噩梦一样可怕，尼奥也愿意相信这一切不过只是场噩梦。而另一个著名黑客莫菲斯的电话让尼奥更加疑惑。为了解开这些疑团，他跟随崔尼蒂来到了莫菲斯的房间。
尼奥发现自己在一个无法想象的地方醒来，随后发生的一切都是他无法理解的。
当尼奥再次醒来时，他发现自己在一艘名叫“尼布甲尼撒号”的飞船上。而莫菲斯等人的形象也发生了巨大的变化，他意识到自己和周围的世界和以前不再相同。
尼奥终于知道了自己的身份，他就是莫菲斯口口声声所说的那个“救世主”。当尼奥知道自己再也回不去后，他开始接受自己的命运。
在“尼布甲尼撒号”的船员中，塞弗是一个特工们有联系的线人。因为塞弗对真实生活感到失望，他希望回到矩阵的虚拟生活中去。因此他出卖了莫菲斯等人。
当莫菲斯决定带尼奥去见先知时，塞弗终于找到了机会。他一进入矩阵，就将手机丢入垃圾桶，以便特工追踪他们的行踪。尼奥见到先知后，却没有得到答案，反而对真相更加疑惑。
当尼奥他们回到接头处，因为他发现两只一模一样的黑猫连续走过，大家才发现特工已经设下了埋伏。最后因为塞弗的出卖，莫菲斯为了救出尼奥，毅然牺牲自己让尼奥逃走。
塞弗先回到了飞船，船上的同伴在毫无防备中被他用激光枪击中。于是尼奥的同伴们相继死去，正在千钧一发之机，重伤的坦克用激光枪击毙了塞弗，将尼奥和崔尼蒂从矩阵中救出。尼奥为了救出莫菲斯，决定去做一件以前从来没有人敢去尝试过的事情。
特工斯密斯正在对莫菲斯严刑拷问，正在这时，尼奥和崔尼蒂杀入特工的总部，经过一番恶斗救出了莫菲斯。
在地铁站内，尼奥为了掩护同伴，毅然留下和特工斯密斯展开恶斗。经过一番追逐后，尼奥还是被特工斯密斯乱枪打死。崔尼蒂和莫菲斯都不敢相信这一切。
尼奥再次复活，并真正开始了解矩阵的奥秘。面对可怕的特工，他不再象以前那样逃避，而是用自己的能力就将子弹阻挡在面前，并轻易地消灭了特工斯密斯。
而这一切并非结尾，故事只是刚刚开始。
“奥西里斯号”飞船在无意间发现成千上万的机器乌贼正在地面集结，并用巨大的机器向地下掘进。船长达里亚斯分析，它们的目的是毁灭位于地下的人类最后的城市——锡安。为了将这个消息送到锡安，“奥西里斯号”飞船展开了最后的绝命飞行。船长达里亚斯的情人乔自告奋勇进入矩阵传送这个紧急信息，同时“奥西里斯号”飞船为了给乔赢得送信的时间，也开始了最后的战斗。虽然最后“奥西里斯号”飞船全体壮烈牺牲，但这个消息终于送达了锡安。
黑客帝国 Ⅱ——重装上阵
锡安的船长们正在秘密开会，讨论机器乌贼的进攻问题。控制中心确认有25万的机器乌贼将在72小时内攻入锡安，但许多船长并不相信这个情报。莫菲斯带着尼奥和崔尼蒂赶到会议现场，请求其中一个船长帮助他等待先知的消息。
会议被一个神秘客人的消息打断，原来尼奥的老朋友——特工斯密斯死而复生，不再受矩阵的控制，并具有了自我复制的能力。
莫菲斯等人回到人类最后的城市锡安，他们将在这里为飞船充电，以便很快返回矩阵寻找先知。莫菲斯和议长哈曼以及司令官洛克之间为如何防御机器乌贼的进攻展开了激烈的争论。
夜晚，成千上万的锡安居民赶到山洞中的圣殿，莫菲斯发表了震撼人心的演说。
狂欢之后，无法入睡的尼奥和议长哈曼就机器的哲学展开了发人深省的讨论。
尼奥赶到矩阵中和先知会面，而先知的守护者塞拉弗的代码居然闪烁着金光，和绿色的矩阵代码完全不同。经过一番打斗后，塞拉弗确信尼奥就是救世主，带他进入了程序员出入的后门程序。
当先知走后，特工斯密斯在群鸦中现身了。尼奥对此并不惊讶，由于此时的尼奥能力比以前更加强大，众多斯密斯都没有能够将他击败。
为了找到关键人物“钥匙匠”，尼奥他们来到了矩阵中另一个和先知一样古老的程序梅罗文加的地盘。梅罗文加并不愿意将“钥匙匠”拱手送出。
这时梅罗文加的妻子帕塞芬意外地表示愿意帮助莫非斯他们。由于有了帕塞芬的帮助，尼奥他们终于找到了神秘的关键人物“钥匙匠”。
梅罗文加带人赶到，尼奥为了掩护莫非斯和崔尼蒂他们，留下和他们展开了一场恶斗。而梅罗文加手下最邪恶的双子幽灵也追踪莫非斯他们来到了高速公路。在这里，莫非斯、双子幽灵和特工三方进行了一场惊心动魄的搏斗。在最后的关键时刻，尼奥赶到救出了莫非斯和钥匙匠。
钥匙匠向船长们讲述了一个重大的秘密，原来他手里的钥匙可以打开通往矩阵源程序的大门。莫非斯相信这将终结人类和机器之间的战争。
当行动开始后，因为有一艘飞船被机器乌贼击毁，崔尼蒂为了挽救任务，不顾尼奥事前的警告而进入矩阵，切断了电源。
当钥匙匠带领尼奥和莫非斯进入到程序员通道后，阴魂不散而又无处不在的斯密斯出现了。最后钥匙匠牺牲了自己，终于打开了通往源程序的大门。尼奥进入到了这个神秘的地方，见到了矩阵的设计师。
崔尼蒂果然如尼奥梦中一般被特工的子弹击中。但尼奥以神奇的速度飞过矩阵，在半空中接住受伤的崔尼蒂，并用手取出了子弹，以他自身的神奇力量让崔尼蒂复活。
在现实世界中，“尼布甲尼撒号”飞船被机器乌贼击毁，尼奥他们在机器乌贼的追击下仓皇逃命。正在这个时候，尼奥忽然感到事情有些不一样，他在现实世界中也具有了矩阵虚拟世界中的超能力，仅仅用手就阻止了机器乌贼。然后他就昏了过去，留给观众们一个巨大的悬念。
黑客帝国 Ⅲ ——矩阵革命
本集故事紧接着上一集的剧情开始了。尼奥在一个虚拟环境中苏醒过来，不知道自己身在何处。而一个小女孩萨蒂告诉他，这是一个归“火车人”管的地方，是独立于矩阵的一个世界。而这个“火车人”则是梅罗文加的手下。
崔尼蒂和莫非斯赶到先知那里，发现先知的外貌已经改变了。先知告诉他们，她为了帮助尼奥，必须要以毁容为代价。先知告诉他们，尼奥现在被困在一个位于矩阵和真实世界中间的地方不能脱身。这个地方归梅罗文加管，如果要救尼奥，就必须要去找他。
尼奥发现自己被困在了地铁站，只能在原地绕圈，根本跑不出这个地方。
莫非斯他们和火车人展开追逐，但火车人很快就摆脱了莫非斯他们。于是莫非斯他们来到了地狱俱乐部找梅罗文加，照例又是一番激烈的枪战后，他们来到了梅罗文加的面前。
尼奥被救出后，发现自己有很多的困惑，于是又找到先知，想知道这些问题的答案。
斯密斯也赶到了先知家中，他感染了所有的人，开始得意地大笑。如果没有人阻止他，斯密斯就将毁灭整个矩阵世界。
所有的人都在为战争做着准备，而一直闭门思考的尼奥终于走了出来。他要一条船前往机器之城，和机器谈判彻底终结战争。所有的人都觉得这个主意很疯狂，因为从来没有人能够到达机器之城。但莫非斯的情人尼俄柏相信尼奥，把自己的船交给了尼奥和崔尼蒂。
在尼奥和崔尼蒂主准备出发时，被特工斯密斯附体的人类拜恩突然袭击了尼奥，将他的眼睛弄瞎了。但这时尼奥忽然发现自己可以不用眼睛就能够看见拜恩，发现了他被斯密斯附体的真相，最后终于杀死了拜恩。
这时机器乌贼已经攻到了锡安，人类和机器在空港展开了残酷的殊死搏斗。人类依靠巨大的机甲战士和乌贼进行着你死我活的战斗，所有的人类都在为自身的生存而战斗着。在最紧急的关头，莫非斯和尼俄柏驾驶飞船及时赶到，用电磁炸弹挽救了即将失败的战局。但是随后更多的机器乌贼赶到，锡安一片混乱，大家都在准备最后的战斗，没有人认为还有幸存的机会。
同时，尼奥和崔尼蒂也在向着机器之城进发。尼奥利用自己的超能力打开了一条血路，在激烈的战斗中，飞船穿越遮蔽了天空的云层，他们第一次见到了光明温暖的太阳。最后他们在付出了惨重的代价后终于达到了机器之城，崔尼蒂也为此付出了生命。尼奥终于和机器开始了谈判，最后以消灭斯密斯为代价达成了和平协议。
在暴雨中的矩阵，尼奥和斯密斯展开了惊天动地的最后决战。他们上天入地，最后终于来到了一切完结的时刻。
机器乌贼从锡安撤离了，战争终于结束了。在矩阵中，先知和建筑师进行了最后的对话，这些悬而又悬的对话似乎为我们揭开了最后的谜底。
关于黑客帝国
骇客任务是什么？只有一群人数稀少的地下斗士知道，可是却没有人想信他们的说法：未来只是幻觉，现实是最可怕的梦魇。
二十二世纪的电脑骇客尼奥，总觉得世界一切都不对劲，却说不出个所以然来。在梦中、在电脑中常会有个声音跟他说话，让他的生活似梦非梦，也让他混淆真实与梦境的界限。直到有一天，有人告诉他，他身负着重大使命，必须武艺高超，才能将全人类从电脑的牢笼中释放出来。
骇客任务是什么？你无从知道，也无法解释，除非你亲身经历，亲眼目睹……
托马斯·安德森是一个貌似普通的年轻人，但他一直用两种方式生活着。一个身份是在一家体面的软件公司里做程序设计员，和所有普通人一样过着平淡无奇的生活；而另一个身份则是电脑世界里的著名黑客，化名是尼奥。作为一个独自居住的人，他一直在做噩梦，就在这一天晚上，他遇到了改变他生活的事件。
在尼奥遇到崔尼蒂后，他的生活就开始变得诡异起来。当他上班时，他接到一个奇怪的电话，并遇到莫名其妙的追杀。
尼奥和特工史密斯的遭遇就象是一个噩梦一样可怕，尼奥也愿意相信这一切不过只是场噩梦。而另一个著名黑客莫菲斯的电话让尼奥更加疑惑。为了解开这些疑团，他跟随崔尼蒂来到了莫菲斯的房间。
尼奥发现自己在一个无法想象的地方醒来，随后发生的一切都是他无法理解的。
当尼奥再次醒来时，他发现自己在一艘名叫“尼布甲尼撒号”的飞船上。而莫菲斯等人的形象也发生了巨大的变化，他意识到自己和周围的世界和以前不再相同。
尼奥终于知道了自己的身份，他就是莫菲斯口口声声所说的那个“救世主”。当尼奥知道自己再也回不去后，他开始接受自己的命运。
在“尼布甲尼撒号”的船员中，塞弗是一个特工们有联系的线人。因为塞弗对真实生活感到失望，他希望回到矩阵的虚拟生活中去。因此他出卖了莫菲斯等人。
当莫菲斯决定带尼奥去见先知时，塞弗终于找到了机会。他一进入矩阵，就将手机丢入垃圾桶，以便特工追踪他们的行踪。尼奥见到先知后，却没有得到答案，反而对真相更加疑惑。
当尼奥他们回到接头处，因为他发现两只一模一样的黑猫连续走过，大家才发现特工已经设下了埋伏。最后因为塞弗的出卖，莫菲斯为了救出尼奥，毅然牺牲自己让尼奥逃走。
塞弗先回到了飞船，船上的同伴在毫无防备中被他用激光枪击中。于是尼奥的同伴们相继死去，正在千钧一发之机，重伤的坦克用激光枪击毙了塞弗，将尼奥和崔尼蒂从矩阵中救出。尼奥为了救出莫菲斯，决定去做一件以前从来没有人敢去尝试过的事情。
特工斯密斯正在对莫菲斯严刑拷问，正在这时，尼奥和崔尼蒂杀入特工的总部，经过一番恶斗救出了莫菲斯。
在地铁站内，尼奥为了掩护同伴，毅然留下和特工斯密斯展开恶斗。经过一番追逐后，尼奥还是被特工斯密斯乱枪打死。崔尼蒂和莫菲斯都不敢相信这一切。
尼奥再次复活，并真正开始了解矩阵的奥秘。面对可怕的特工，他不再象以前那样逃避，而是用自己的能力就将子弹阻挡在面前，并轻易地消灭了特工斯密斯。
而这一切并非结尾，故事只是刚刚开始。
第二部
假若明天这场战争能够结束？难道不值得为之战斗吗？难道不值得为之牺牲吗？
一切都从“选择”开始。
现在，当人类最后的城市锡安陷入机器军队的包围时，墨菲斯的信念鼓舞了锡安的人们，他们相信“救世主”尼奥将实现先知的预言，结束与机器们的战争。他们把所有的希望都寄托在尼奥的身上。积弱的锡安防守力量根本不足以对抗强大的机甲兵团，尼奥必须和他的战友们一起将敌人彻底消灭。而尼奥在寻找行动的方向时，发现自己陷入令人烦恼的幻觉之中……
“奥西里斯号”飞船在无意间发现成千上万的机器乌贼正在地面集结，并用巨大的机器向地下掘进。船长达里亚斯分析，它们的目的是毁灭位于地下的人类最后的城市——锡安。为了将这个消息送到锡安，“奥西里斯号”飞船展开了最后的绝命飞行。船长达里亚斯的情人乔自告奋勇进入矩阵传送这个紧急信息，同时“奥西里斯号”飞船为了给乔赢得送信的时间，也开始了最后的战斗。虽然最后“奥西里斯号”飞船全体壮烈牺牲，但这个消息终于送达了锡安。
锡安的船长们正在秘密开会，讨论机器乌贼的进攻问题。控制中心确认有25万的机器乌贼将在72小时内攻入锡安，但许多船长并不相信这个情报。莫菲斯带着尼奥和崔尼蒂赶到会议现场，请求其中一个船长帮助他等待先知的消息。
会议被一个神秘客人的消息打断，原来尼奥的老朋友——特工斯密斯死而复生，不再受矩阵的控制，并具有了自我复制的能力。
莫菲斯等人回到人类最后的城市锡安，他们将在这里为飞船充电，以便很快返回矩阵寻找先知。莫菲斯和议长哈曼以及司令官洛克之间为如何防御机器乌贼的进攻展开了激烈的争论。
夜晚，成千上万的锡安居民赶到山洞中的圣殿，莫菲斯发表了震撼人心的演说。
狂欢之后，无法入睡的尼奥和议长哈曼就机器的哲学展开了发人深省的讨论。
尼奥赶到矩阵中和先知会面，而先知的守护者塞拉弗的代码居然闪烁着金光，和绿色的矩阵代码完全不同。经过一番打斗后，塞拉弗确信尼奥就是救世主，带他进入了程序员出入的后门程序。
当先知走后，特工斯密斯在群鸦中现身了。尼奥对此并不惊讶，由于此时的尼奥能力比以前更加强大，众多斯密斯都没有能够将他击败。
为了找到关键人物“钥匙匠”，尼奥他们来到了矩阵中另一个和先知一样古老的程序梅罗文加的地盘。梅罗文加并不愿意将“钥匙匠”拱手送出。
这时梅罗文加的妻子帕塞芬意外地表示愿意帮助莫非斯他们。由于有了帕塞芬的帮助，尼奥他们终于找到了神秘的关键人物“钥匙匠”。
梅罗文加带人赶到，尼奥为了掩护莫非斯和崔尼蒂他们，留下和他们展开了一场恶斗。而梅罗文加手下最邪恶的双子幽灵也追踪莫非斯他们来到了高速公路。在这里，莫非斯、双子幽灵和特工三方进行了一场惊心动魄的搏斗。在最后的关键时刻，尼奥赶到救出了莫非斯和钥匙匠。
钥匙匠向船长们讲述了一个重大的秘密，原来他手里的钥匙可以打开通往矩阵源程序的大门。莫非斯相信这将终结人类和机器之间的战争。
当行动开始后，因为有一艘飞船被机器乌贼击毁，崔尼蒂为了挽救任务，不顾尼奥事前的警告而进入矩阵，切断了电源。
当钥匙匠带领尼奥和莫非斯进入到程序员通道后，阴魂不散而又无处不在的斯密斯出现了。最后钥匙匠牺牲了自己，终于打开了通往源程序的大门。尼奥进入到了这个神秘的地方，见到了矩阵的设计师。
崔尼蒂果然如尼奥梦中一般被特工的子弹击中。但尼奥以神奇的速度飞过矩阵，在半空中接住受伤的崔尼蒂，并用手取出了子弹，以他自身的神奇力量让崔尼蒂复活。
在现实世界中，“尼布甲尼撒号”飞船被机器乌贼击毁，尼奥他们在机器乌贼的追击下仓皇逃命。正在这个时候，尼奥忽然感到事情有些不一样，他在现实世界中也具有了矩阵虚拟世界中的超能力，仅仅用手就阻止了机器乌贼。然后他就昏了过去，留给观众们一个巨大的悬念。
第三部
放弃人类的命运？还是放弃自己的爱人？
救世主尼奥冒着人类最后的地底世界「锡安」被母体摧毁的危险，奋力解救生命垂危的崔妮蒂，但是他也因此由「造物主」那儿得知，人类曾经在与母体的战争中，被毁灭了五次，这次将会是第六次人类世界被母体消灭。同时，锡安的人们面临母体机械大军的入侵，人类也赌上所有武力，发动最后攻势。此外，机器特工史密斯正在变成系统最大的威胁。
如此复杂混乱的局面，先知也无法预言最后的结局。系统本身更是矛盾重重，尼奥只能依靠自己的判断决定人类与机器的命运……
本集故事紧接着上一集的剧情开始了。尼奥在一个虚拟环境中苏醒过来，不知道自己身在何处。而一个小女孩萨蒂告诉他，这是一个归“火车人”管的地方，是独立于矩阵的一个世界。而这个“火车人”则是梅罗文加的手下。
崔尼蒂和莫非斯赶到先知那里，发现先知的外貌已经改变了。先知告诉他们，她为了帮助尼奥，必须要以毁容为代价。先知告诉他们，尼奥现在被困在一个位于矩阵和真实世界中间的地方不能脱身。这个地方归梅罗文加管，如果要救尼奥，就必须要去找他。
尼奥发现自己被困在了地铁站，只能在原地绕圈，根本跑不出这个地方。
莫非斯他们和火车人展开追逐，但火车人很快就摆脱了莫非斯他们。于是莫非斯他们来到了地狱俱乐部找梅罗文加，照例又是一番激烈的枪战后，他们来到了梅罗文加的面前。
尼奥被救出后，发现自己有很多的困惑，于是又找到先知，想知道这些问题的答案。
斯密斯也赶到了先知家中，他感染了所有的人，开始得意地大笑。如果没有人阻止他，斯密斯就将毁灭整个矩阵世界。
所有的人都在为战争做着准备，而一直闭门思考的尼奥终于走了出来。他要一条船前往机器之城，和机器谈判彻底终结战争。所有的人都觉得这个主意很疯狂，因为从来没有人能够到达机器之城。但莫非斯的情人尼俄柏相信尼奥，把自己的船交给了尼奥和崔尼蒂。
在尼奥和崔尼蒂主准备出发时，被特工斯密斯附体的人类拜恩突然袭击了尼奥，将他的眼睛弄瞎了。但这时尼奥忽然发现自己可以不用眼睛就能够看见拜恩，发现了他被斯密斯附体的真相，最后终于杀死了拜恩。
这时机器乌贼已经攻到了锡安，人类和机器在空港展开了残酷的殊死搏斗。人类依靠巨大的机甲战士和乌贼进行着你死我活的战斗，所有的人类都在为自身的生存而战斗着。在最紧急的关头，莫非斯和尼俄柏驾驶飞船及时赶到，用电磁炸弹挽救了即将失败的战局。但是随后更多的机器乌贼赶到，锡安一片混乱，大家都在准备最后的战斗，没有人认为还有幸存的机会。
同时，尼奥和崔尼蒂也在向着机器之城进发。尼奥利用自己的超能力打开了一条血路，在激烈的战斗中，飞船穿越遮蔽了天空的云层，他们第一次见到了光明温暖的太阳。最后他们在付出了惨重的代价后终于达到了机器之城，崔尼蒂也为此付出了生命。尼奥终于和机器开始了谈判，最后以消灭斯密斯为代价达成了和平协议。
在暴雨中的矩阵，尼奥和斯密斯展开了惊天动地的最后决战。他们上天入地，最后终于来到了一切完结的时刻。
机器乌贼从锡安撤离了，战争终于结束了。在矩阵中，先知和建筑师进行了最后的对话，这些悬而又悬的对话似乎为我们揭开了最后的谜底。
求，黑客帝国1的详细剧情，最好是看过的，我看不懂，谢谢
人类发明了AI（人工智能），大家都懂得，人什么人都有，有些人制造了病毒程序，然后因为种种原因，这些病毒程序失去了控制（比如编写者死亡或病毒升级），然后他们流亡在网络环境里，逐渐控制了机械，然后依靠机械同 人类展开战争，最终人类失败，遮盖了天空，妄图以此来断绝机器的能源来源（太阳能），然而机器发现人体可以供电， 便批量“栽植”了大量人类，用生命素供给人体所需的营养，然后把人的“灵魂”囚禁在一个名为母体的高逼真的“电脑游戏”里，让他们在那里“生活”以保持人体的活性。
然后有人苏醒了，回到了“现实世界”，开始进入母体营救仍在“沉睡”中的人（第一代救世主）。
这个是背景
一个据说可以预知未来的先知告诉反抗组织，找到救世主就可以结束战争，反抗组织其中的一个领导人物莫菲斯对此深信不疑，并找到了尼欧，认为他就是救世主，把他从母体中救出来，对他进行训练，然后带他去看先知，然后先知见到尼欧之后，却说他不是救世主，而同时，莫菲斯的一个属下叛变，他们被电脑人困住，为了救出尼欧，莫菲斯被擒，尼欧决定营救莫菲斯，跟崔尼蒂两人成功将他救出来，但在最后的逃亡中，尼欧被电脑人抓住，并被打死，然后崔尼蒂在现实中吻了尼欧，尼欧复活，拥有了看穿部分代码的能力（超能力），然后杀死电脑人史密斯。
这是第一集。
在第一集的末尾，尼欧拥有了超能力，如飞行，而且可以比较轻易的打败电脑人，然而由于尼欧的复活，程序出现了逻辑性的错误，史密斯拒绝被删除，并且升级，变成了病毒，拥有了复制自己的能力，实力不断增强。而尼欧等经过重重波折，最终来到万物之源，见到了设计师，设计师告诉尼欧，在他的前身还有五代救世主，言语中所包含的意思似乎他们认为是现实世界的锡安也并非是真实世界，并且，人类的家园锡安即将被毁灭，尼欧只能做出两个选择，一是进入主机，在锡安毁灭后重建锡安，但是这样的话崔尼蒂就会死；第二是出去营救崔尼蒂，放弃拯救世界，尼欧最终选择了后者。
这是第二集。
接上集，尼欧发现自己竟然在现实世界中也拥有部分超能力，能够用念力杀死机器乌贼，然后昏迷，不经过连线意念进入虚拟世界中，并被一个名叫火车人的程序困在虚拟和现实之间的一个地方，莫菲斯等人将他营救出来，而同时机器展开了对锡安的总攻，人类束手无策，坐等灭亡，尼欧带着崔尼蒂闯入机器城，跟其首脑谈判，让自己去跟史密斯决斗，机器停止对人类的进攻，最终尼欧跟史密斯一起被删除，战争结束，母体实现了再次升级
黑客帝国可以这样理解么
最早人类发明机器为人类服务，后来人类发明的机器具备高级智商，甚至超越了人类的大脑（AI: artifical Intelligence）。机器觉得被人类统治（奴役）了很不爽，就跟人类打了一仗，人类打不过机器，就把发明了一种化学大气层遮蔽了太阳能，太阳能是机器的能量来源，但是机器并没有因此失去动力，机器发明了新的能源---人体电能，但是人类当然不愿把自己给机器当电池，所以机器只能通过基因工程用人体细胞来生产出一个活人，并在活人体内插入金属电极和插头，以便为机器供电。那么机器就有了新能源，机器赢得战争，人类不得不躲到地下并建立易安。但是新的问题又产生了，就算是基因工程生产的人群，毕竟也是完整的人，有人性，也不会乖乖受到机器的奴役，那么机器是怎么统治这些电池人的呢？
机器制造了一个核心计算机，这个核心计算机就是造物主，换句话说核心计算机（造物主）代表了机器的立场。这个计算机具备自主编写操作系统和程序的能力，因此这台计算机理解不了人类的行为，只懂得数学公式，符合编程的逻辑。计算机连接着一个巨大的服务器，这个服务器就是Matrix（矩阵）。计算机为服务器编写一切程序，机器人把电池人的大脑跟服务器连接，那么电池人的意识就在服务器里生活（有点儿像网游玩家活在Dota的服务器里），如果在服务器里一个电池人死了，那么在现实中电池人的大脑会认为自己死了，所以在现实中就真的死了，也就停止供电了。
计算机为服务器编写的第一个人类虚拟世界是完美的（应该是人类所有要求都可以满足，比如你想要啥啥都从天上掉下来，要钱掉钱，要美女掉美女，要帅哥掉帅哥，要房要车都马上变出来），但是计算机不知道人类本身就是有缺陷的，所以第一个虚拟世界里的所有人都死了，那么现实中的所有电池人都死了，机器又没有电源了。
机器又繁育了一批新电池人，让计算机为服务器编写新程序。计算机通过第一次失败知道人类不能活在完美世界里，所以就编写了充满人类人性丑陋的世界，第二个虚拟世界也没有成功，电池人的意识在虚拟世界中死去也就在现实中死去也就无法供电了。
在此期间，计算机为服务器编写了五个安全程序，用来保证系统安全，第一个是操作系统杀毒软件（相当于360扫描），就是在虚拟世界里的警察，他们可以防止虚拟世界里的电池人意识的犯罪。第二个是硬盘杀毒软件（相当于卡巴斯基硬盘保护），就是电脑人（Agent），他们要比警察高级，必要时可以以任何一个程序作为载体变身，从而达到保护系统不被外来黑客攻击的效果。第三个就是实时监控程序（相当于瑞星实时监控），这个就是法国人梅罗纹奇，法国人程序的能力是计算过去发生过的一切事情，所以就有了监控的作用，同时法国人程序属于高级程序，可以为母体编写一些小的程序，比如“蛋糕”包括“双胞胎”都是法国人的杰作。第四个是认证系统（相当于USB接口），就是火车人和火车，火车是USB插口和插口到硬盘的连线，火车人就相当于U盘的驱动程序，他的作用是连接服务器里的软件和与服务器连接的硬件设备，所以就是虚拟世界和现实世界的过度，所有的电池人的大脑要想进入服务器Matrix就必须通过火车人的认证，火车人跟法国人连在一起就像实时监控系统+认证程序具有保卫系统安全的协同作用，一个维持内部安全，一个确保外界进入内部的东西是安全的。第五个是防火墙（诺顿防火墙），就是计算机（造物主）的那栋大楼，如果防火墙检测到服务器里的程序试图非法进入计算机，防火墙就会关闭计算机和服务器的接口（大楼爆炸），防止程序入侵。
但是只要是规定就可以被改变或打破。因此这五个安保系统都被人类黑客破解了。
现在画面转到人类。为什么机器没有追到易安并彻底摧毁？原因如下：如果计算机不能为服务器编辑一个让每一个电池人的意识都可以好好活着的虚拟世界，那么电池人在现实中就无法正常供电，那么机器世界就没有能源。因此，为了让造物主计算机可以编写好的程序，就必须先要彻底了解人类；为了彻底了解人类，就要保留人类纯正活体并观察；为了保留人类纯正活体并观察，就不能彻底摧毁易安！
人类躲到易安之后，人类造了5个体系：1，交通，就是飞船和管道；2，居住场所，就是桥屋；3，能源设备，就是岩浆地热发电机和污水循环系统；4，武装保卫体系，包括电磁波，机器战士和大门。5，中央控制系统，就是委员会（相当于党委书记或政委）和中央控制办公室（相当于市长或师长），来确保整体协调。易安还想再次摧毁机器世界，叫地下的崛起，他们认为摧毁机器世界的方法肯定不是去荷枪实弹的打，因为机器有几亿个士兵和几亿发炸弹，而人类只有几十个士兵和几艘飞船，就像几个幼儿园的小孩手里拿着超人玩具要战胜几万个装备齐全的特种部队一样。因此人类必须通过其他办法来摧毁机器世界，跟上次通过隔断太阳能让机器没有能源一样，这次还要让机器没有能源，那么就要摧毁服务器，这样电池人就没有意识也就死了，机器人就没电了。要摧毁服务器（矩阵），就要先了解矩阵，于是易安派出飞船来潜入到服务器机房附近，并通过WiFi（无线网路由器信号发射）技术连接飞船人员的意识和虚拟世界，这个技术就叫黑客技术。因为程序进入服务器的常规途径是防火墙（造物主的那个大楼）和USB接口（火车人）。但是船员绕过这些常规来进入系统的办法就叫黑客。他们出入的路径就是虚拟世界电话连接虚拟世界电话线连接服务器的调制解调器连接飞船WiFi路由器连接船员大脑和飞船总机。船员进入服务器的目的跟服务器的目的是不一致的，服务器的目的（Purpose）是让电池人的大脑稳定以便为机器世界供电，而船员进入服务器是为了干扰电池人的大脑以便不能正常供电。
但是任何规定都有例外，再完美和平衡的公式也不是万能的，还是有极个别的电池人的大脑（脑电波天生很强，多半是大脑皮层的神经末梢比常人发达的原因）意识到他们活在服务器里，而不是真正地世界，于是他们试图在服务器里通过虚拟网络来验证他们的意识是否在服务器里。而且赶巧，船员黑客在服务器（Matrix矩阵）里发现了一批这样“叛逆”的电池人，于是决定把他们解救出来。解救方法是在服务器里跟他们取得联络，让他们知道他们确实活在服务器里，然后给他们药片让他们自己选择是否出来还是留下，红药片是追踪程式，可以让飞船知道他们的意识在服务器里的坐标；蓝色药片是休眠程式，可以让他们的意识睡觉，然后再醒过来就感觉什么都没有发生。如果他们服用红药，飞船就修改他们的意识，让他们苏醒，电池人苏醒后从电池壳里爬出来，爬出来拔掉电源线、撕破囊膜后，这块电池就停止给机器的一个电极供电，机器检测到这块电池不工作了，就认为没有意义了，直接通过下水道排出，然后再被飞船打捞上来进行重新改造。
就这样墨菲斯、崔尼蒂等电池人先后上船了。
现在画面再切回造物主计算机，计算机意识到电池人一个接一个的被易安飞船解救，于是就觉得前五个安保系统没有什么价值，就创造了第六个安保系统：第六个安保系统就是先知婆（Oracle），计算机通过对人类的不断了解发现了人类的第六感、直觉、通灵感、潜意识等可以通过数学公式来编写到程序里，计算机把人类预知未来的能力写入了先知婆程序里，那么这个先知婆就可以预测在未来的什么时候什么坐标的电池人会被易安飞船救走。那么那个法国人就失业了。先知婆取代了法国人这个实时监控系统。因为先知婆可以预测未来，而法国人只能知道已经发生过的事情，所以就防止电池人被易安飞船救走这个目的而言，先知婆要比法国人NB。就像如果有一个系统可以预测未来所有的犯罪，那么你还会雇佣现在的警察吗？这也就是为什么法国人非常痛恨先知婆而要她的眼睛的原因。
但是，先知婆对于计算机、服务器和机器世界来说虽然有优点，但是缺点也非常明显，先知婆被植入的是第六感，而第六感的基础是人格，所以先知婆并不完全收到公式和数学的影响，先知婆有自己的意识和独立的人格，因此先知婆也就有自己的独立的编程能力和行动力，以及善恶观。先知婆为了自己的安全为自己编写了黄飞鸿私人保镖程序。先知婆知道人类和机器之间的矛盾必须被和平解决。因此先知婆帮助易安人和被解救的电池人墨菲斯还有崔尼蒂等寻找The One（Saver救世主）。
那么关键就是这个救世主到底是怎么回事儿呢？
是这样的：在第一次先知婆跟易安飞船取得联系之后，计算机就已经通过法国人知道先知婆“叛变了”，计算机意识到自己的公式看似完美无缺，但是无法平衡不能控制的人格独立化（自由Freedom）。而且计算机也意识到光在服务器里编写的程序是不能完全屏蔽易安黑客的干扰。举个例子，在现实中防止一个黑客犯罪最好的办法不是在网络上拼技术，而是找到这个黑客然后杀死他。前六套安保系统都是治标不治本。因此要想让易安黑客不干扰服务器，就必须找一个活人来去潜入易安黑客，然后观察并了解易安黑客和人类行为。因此，第七套安保系统就叫救世主，那么这个救世主应该具备三位一体的能力：1，软件，就是可以在服务器里存在；2，机器，就是理解机器并跟机器交流；3，人格，就是也要理解人并跟人类交流。因此，救世主是由三个部分组成的：人类的身体，机器金属的部分，可以随时进出并改造服务器的的软件性意识。
过程是这样的：机器人选一个电池人作为救世主的肉身，在这个电池人肉体内植入机器金属，要比电极复杂的一些零件，最后在矩阵里为他的大脑植入软件意识。那么作为肉身，救世主可以跟人类交流，就是救世主----人类的连接线。作为机器部分，救世主可以感受机器，这就是为什么Neo好几次说 I can fee them(them 指的是乌贼机器兵)，就是救世主---机器的连线。作为软件部分，救世主可以随意进出服务器并且改造服务器，就是可以看到服务器的数据来在虚拟世界里打败电脑人史密斯以及中弹不死或者像超人一样飞来飞去等，就是救世主---虚拟世界的连线。作为人、鬼、神三界通灵的救世主，他是一个点，把机器世界、易安人类、虚拟世界连接在了一起。
但是救世主的最初目的是由造物主计算机设计的：救世主被易安救走，计算机通知机器，机器派乌贼摧毁易安，但是留些活口，救世主回到易安，挑选男女重建易安，然后救世主的意识变为源代码回到造物主计算机那里，计算机再根据之前的过程发现人类、救世主、机器、系统的缺陷，然后从新更新一批新版本，然后这个过程就一直循环往复下去，直到Neo停止了一切。
那么先知婆既然有预测能力，在计算机还没有开始第七个安保系统---救世主的时候，先知婆就已经知到这一切，而且先知婆知道无论是自己还是人类能力都是很有限的，因此要告诉易安人类、电池人墨菲斯、崔尼蒂等未来会有这么一个救世主，他的能力是非常全面的，也只有他可以停止人类和机器的战争。
先知婆和易安的前几次合作都以失败告终，直到最新一代造物主Neo，先知婆也预测出来前几次都会失败，直到Neo才能成功。先知婆预测出Neo的独特之处就是在具备人、机器、虚拟部分的基础上，还有“爱”（Love），爱是唯一一个计算机没有办法用公式来平衡的东西。因为爱往往带表着自我牺牲，这种代价超过了可以被量化的程度。Neo最初的爱是和崔尼蒂的爱情，然后转化成了对人类、机器和虚拟世界的博爱，并最后选择自我牺牲。
在一次Neo和史密斯的战斗中，Neo打败了史密斯，史密斯被Neo给“破裂”了，作为一个任务失败的电脑人，史密斯应该被系统删除，但是系统没能删掉它，原因是Neo如果是完美的正义，那么史密斯必须是完美的邪恶，否则的话服务器就会失去平衡，从而烧毁。因此，史密斯变成了病毒，具备侵入其他程序并改造其他程序来复制自己的能力，复制之后会获取原来载体的基因、记忆和能力，这叫病毒的变异与进化，而无休止的破坏平衡就是病毒存在的意义。史密斯也复制了先知婆，于是史密斯具备了预知未来的能力，史密斯也就获得了破坏未来平衡的能力，从而大笑。
Neo如果通过飞船进入服务器，就是黑客行为，可以绕过火车人。但是如果史密斯通过自己的意识WiFi跟服务器连接，这就是软件意识，是计算机的设计程序，Neo则必须通过常规途径进入服务器，就是火车人。这就是在Neo晕倒后凭借自己的意识创建WiFi信号跟服务器连接的时候，就必须要通过火车人的认证，但是火车人效忠实时监控程序，而实时监控程序法国人梅罗纹奇有自己的情感，痛恨Neo、人类和先知婆，告诉火车人不要带Neo的软件意识进入服务器。然后墨菲斯、崔尼蒂、黄飞鸿必须通过爱的力量亲自战斗，挟持实时监控系统来命令认证程序把史密斯带出来。 这叫黑客交易（Make a deal）。
按照计算机设计的固定程式，救世主Neo被解救，造物主计算机通知机器世界准备排出机器乌贼大举进攻易安开始新的一个循环，但是就连造物主自己都不知道，服务器正在被病毒史密斯大量的入侵，电池人的意识都变成了病毒史密斯，如果不停止史密斯的继续复制，结果就是史密斯把服务器里的所有程序都变成史密斯，那么服务器就坏死了，史密斯还会大举入侵造物主计算机，那么造物主计算机就必须关闭防火墙（大楼爆炸），然后服务器就彻底坏死，这时候电池人的意识就不受服务器的奴役，那么电池人的意识都是史密斯，电池人从电池囊膜里苏醒，目的只有一个：就是病毒史密斯的目的：摧毁一切平衡，摧毁整个世界，无论是机器世界还是易安人类世界。
因此，Neo以帮助破坏史密斯为筹码，跟机器国王谈判，机器国王同意跟人类停止战争，维系和平，前提是Neo愿意把自己复制给史密斯，这样的话计算机就可以找到史密斯里的Neo，从而定位所有史密斯的坐标，来杀死史密斯。换句话说，史密斯是新病毒，现有的杀毒软件版本对史密斯病毒无效，但是Neo是一个专门杀死史密斯病毒软件的定位程序，如果Neo愿意自我牺牲来定位史密斯病毒，那么现有的杀毒软件就可以杀死这个史密斯新病毒，阻止人类、机器、虚拟世界的毁灭。
因此，可以想象，在Neo被史密斯复制后，造物主计算机找到了Neo的位置，也就找到了史密斯的位置，并杀死了全部史密斯。但是造物主计算机的逻辑是数学公式，是非常定数的东西，既然计算机答应Neo如果Neo成功帮助杀死史密斯，那么计算机就放了所有想要逃离机器世界和虚拟世界摆布的电池人，让他们回到易安，并且停止进攻易安，让人类自己去决定自己的命运（set them free 就是让他们获得自由）。这就是结尾造物主计算机告诉先知婆我还不至于不守信用的意思。
但是可以想象：机器人履行承诺，让计算机释放了那些选择要脱离母体的电池人，电池人回到易安，易安变得强大，那是否有一天人类的独立发展，人类的贪婪和欲望的膨胀，还会和机器人继续发生战争，和平又一次被打破，这就是为什么计算机在最后问了先知婆这样一个问题：How long you think the peace will last？ 你认为这样的和平可以维系多久？ 先知婆说：as Long as it can be. 应该多久就是多久。
至于那个小女孩莎蒂，就是爱的象征。莎蒂的父亲是电厂程序，莎蒂的母亲是软体程序，两个程序是计算机用数学公式编写出来为服务器虚拟世界Matrix工作的程序，但是奇迹的一点就是用数学公式编写的程序居然产生了爱情和爱的结晶：女儿莎蒂。法国人实时监控系统监测到电厂程序和软体程序产生了爱，而莎蒂一家三口是爱，也就是数学公式无法读取的，不属于服务器系统，应该被删除（Dekete），出于对女儿莎蒂的爱，电厂和软体找到先知婆，先知婆同意留下他们的女儿莎蒂，方法是电厂程序和软体程序和他们的女儿“莎蒂”必须到达火车站，也就是USB端口处，然后先知预婆预测出造物主计算机为了研究“爱”和跟踪先知婆的坐标，会让实时监控系统法国人梅罗纹奇告诉USB端口认证程序火车人把莎蒂（Love，爱）带到母体作为研究对象，但是莎蒂的父母的目的不是产生爱情和女儿，而是单纯的电厂和电厂软体，因此既然违背了服务器目的，自然要被系统永久删除。但是已经具备独立人格的软件电厂和软体依然愿意以爱为目的，以牺牲自我为代价，回到USB端口，把女儿解救出去，不让系统删除女儿，但是可以删除自己。
这部电影告诉我们一个道理：世界的趋势不会以任何一种势力（人或机器或虚拟世界）的意志被改变，因为每一种势力都可以用自己的意志改变世界的一些规矩（Rules or Laws）,比如说人的改变能力就是“爱”(Love)。请人类善待自己赖以生存的环境和机器，用爱对待他们，不要把他们当成比自己低等的东西，要认为他们也有尊严和情感。否则，就是作茧自缚，自我毁灭。